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6.3.1 Mise en place d'outils

Les divers algorithmes que j'ai élaborés doivent être mis à disposition du public sur le site de l'Institut Pasteur (la création des pages WEB est réalisée par C. Letondal), éventuellement initialement dans des versions simplifiées (i.e. ayant moins de paramètres à régler). L'algorithme de recherche de satellites que j'ai développé avec Gene Myers [16] [17] a ainsi été placé sur le WEB en version bêta en Août 1998 ( http://bioweb.pasteur.fr/docs/gensoft-na.html#SATELLITES). Doivent suivre dans les prochains mois l'algorithme décrit dans [19] (au départ, pour ce qui concerne la recherche de triplets et pseudo-n\oeuds uniquement) et celui qui sera publié dans [20] [21] (et qui est fonctionnel depuis 1996). Par ailleurs, je compte présenter un séminaire interne à l'Institut sur chacun de ces algorithmes, le but principal étant ici d'éventuellement susciter le dialogue et des interactions avec des biologistes.

Enfin, une collaboration est également en cours (depuis Septembre 1997) avec C. Letondal afin d'établir une interface graphique à certains de ces algorithmes. Cette interface sera réalisée avec l'aide de divers biologistes de l'Institut Pasteur qui ont bien voulu se prêter à des simulations (voir la section 5.2), pour l'instant sur des logiciels développés par d'autres, puis sur l'environnement que C. Letondal a l'intention de construire au fur et à mesure que l'interface prendra forme.


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