Listes de références et articles généraux

Les articles indiqués ici ont un caractère général, ils donnent des conseils et des références utiles même avant de commencer le cours :

– Sources utiles pour débuter en Scheme : comme son nom l’indique, la liste des choses dont vous aurez besoin avant de commencer, et où les trouver ;

– L’histoire des langages Lisp : l’histoire de la matière enseignée est toujours bonne à connaître, et renseigne sur les intentions des auteurs et aide à la compréhension ;

– Quelle formation pour les biologistes du 21e siècle ? : Pavel Pevzner vous explique ici pourquoi les biologistes doivent apprendre à programmer ;

– Pourquoi Scheme ? : justification de certains de mes choix pédagogiques ;

– Apprendre à programmer : où est le problème ? : quelques références pour une réflexion sur la difficulté d’apprendre à programmer, et les moyens de la surmonter.

Installer ses outils

Avant d’attaquer l’apprentissage de la programmation, il vous faudra installer quelques outils, ce qui n’est pas forcément le plus facile.

– Installer Bigloo sur votre ordinateur ;

– Installer Bigloo sous Windows avec Cygwin ;

– Installer Bigloo sous Windows ;

– paramétrer Emacs pour Bigloo ;

– Installer Java sur votre ordinateur sous Linux (Bigloo interagit avec Java) ;

– Installer Bigloo sous MacOS X.

Pour débuter

– Algorithme itératif : une méthode empirique ;

– reverse sans append ;

– Le compte est bon ;

– Construire un algorithme itératif ;

– Transposition de matrice en une ligne : un tour de passe-passe ?

Compiler un programme

Du bon usage de la compilation

Compilation séparée et modules de Bigloo

Entrées-sorties

– Entrées-sorties en Scheme ;

– Lire une séquence SwissProt.

Utiliser les types de données

– Envoi de messages et encapsulation ;

– Création d’un type de données : les tables ;

– Liste d’associations ou hash-tables ? ;

– Vecteurs de Bigloo ;

– Création d’un type de données : les tables ;

– Combiner vecteurs et listes associatives : les hash tables.